EXCEL

Excel...

Microsoft Excel is a commercial spreadsheet application written and distributed by Microsoft for Microsoft Windows and Mac OS X. It features calculation, graphing tools, pivot tables and a macro programming language called Visual Basic for Applications. It has been a very widely applied spreadsheet for these platforms, especially since version 5 in 1993. Excel forms part of Microsoft Office. The current versions are 2010 for Windows and 2011 for Mac.







Linear regression

Introduction to linear regression
Linear regression analyzes the relationship between two variables, X and Y. For each subject (or experimental unit), you know both X and Y and you want to find the best straight line through the data. In some situations, the slope and/or intercept have a scientific meaning. In other cases, you use the linear regression line as a standard curve to find new values of X from Y, or Y from X.
The term "regression", like many statistical terms, is used in statistics quite differently than it is used in other contexts. The method was first used to examine the relationship between the heights of fathers and sons. The two were related, of course, but the slope is less than 1.0. A tall father tended to have sons shorter than himself; a short father tended to have sons taller than himself. The height of sons regressed to the mean. The term "regression" is now used for many sorts of curve fitting.
Prism determines and graphs the best-fit linear regression line, optionally including a 95% confidence interval or 95% prediction interval bands. You may also force the line through a particular point (usually the origin), calculate residuals, calculate a runs test, or compare the slopes and intercepts of two or more regression lines.
In general, the goal of linear regression is to find the line that best predicts Y from X. Linear regression does this by finding the line that minimizes the sum of the squares of the vertical distances of the points from the line.
Note that linear regression does not test whether your data are linear (except via the runs test). It assumes that your data are linear, and finds the slope and intercept that make a straight line best fit your data.

Quadratic Regression is a process by which the equation of a parabola is found that “best fits” a given set of data.Quadratic regression models are often used in economics areas such as utility function, forecasting, cost-befit analysis.

Beer`s law plot data

Titration

answer for question 1

answer for question 2

http://www.graphpad.com/curvefit/linear_regression.htm 

http://en.wikipedia.org/wiki/Microsoft_Excel

SMILES :)

What`s that????

SMILES contains the same information as might be found in an extended connection table. The primary reason SMILES is more useful than a connection table is that it is a linguistic construct, rather than a computer data structure. SMILES is a true language, albeit with a simple vocabulary (atom and bond symbols) and only a few grammar rules. SMILES representations of structure can in turn be used as "words" in the vocabulary of other languages designed for storage of chemical 

information (information about chemicals) and chemical intelligence (information about chemistry).

Part of the power of SMILES is that unique SMILES exist. With standard SMILES, the name of a molecule is synonymous with its structure; with unique SMILES, the name is universal. Anyone in the world who uses unique SMILES to name a molecule will choose the exact same name.

One other important property of SMILES is that it is quite compact compared to most other 

methods of representing structure. A typical SMILES will take 50% to 70% less space than an equivalent connection table, even binary connection tables. For example, a database of 23,137 structures, with an average of 20 atoms per structure, uses only 1.6 bytes per atom when represented with SMILES. In addition, ordinary compression of SMILES is extremely effective. The 

same database cited above was reduced to 27% of its original size by Ziv-Lempel compression (i.e. 0.42 bytes per atom).

Here are some of the images that I had done on this topic;

http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smiles.html
http://en.wikipedia.org/wiki/Smile

protein data bank

WHAT is PDB???

The Protein Data Bank (PDB) is a repository for the 3-D structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids. (See also crystallographic database). The data, typically obtained by X-ray crystallography or NMR spectroscopy and submitted by biologists and biochemists from around the world, are freely accessible on the Internet via the websites of its member organisations (PDBe, PDBj, and RCSB). The PDB is overseen by an organization called the Worldwide Protein Data Bank, wwPDB.

The PDB is a key resource in areas of structural biology, such as structural genomics. Most major scientific journals, and some funding agencies, such as the NIH in the USA, now require scientists to submit their structure data to the PDB. If the contents of the PDB are thought of as primary data, then there are hundreds of derived (i.e., secondary) databases that categorize the data differently. For example, both SCOP and CATH categorize structures according to type of structure and assumed evolutionary relations; GO categorize structures based on genes.^[1]

HISTORY...

The PDB originated as a grassroots effort.^[1] In 1971, Walter Hamilton of the Brookhaven National Laboratory agreed to set up the data bank at Brookhaven. Upon Hamilton's death in 1973, Tom Koeztle took over direction of the PDB. In January 1994, Joel Sussman was appointed head of the PDB. In October 1998,^[2] the PDB was transferred to the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB); the transfer was completed in June 1999. The new director was Helen M. Berman of Rutgers University (one of the member institutions of the RCSB).^[3] In 2003, with the formation of the wwPDB, the PDB became an international organization. The founding members are PDBe (Europe), RCSB(USA), andPDBj (Japan). The BMRB joined in 2006. Each of the four members of wwPDB can act as deposition, data processing and distribution centers for PDB data. The data processing refers to the fact that wwPDB staff review and annotates each submitted entry. The data are then automatically checked for plausibility. (The source code for this validation software has been made available to the public at no charge.

FTSH peptidase...

image of ftsh peptidase

Author	Tomaras, A.P.,
Experiment	X-RAY DIFFRACTION with resolution of 2.00 Å
Chain	A
EC	3.6.5.4

Gene Ontology

Cellular component	protein complex (GO:0043234)
Biological process	protein polymerization (GO:0051258)

THERMOLYSIN...

image of termolysin

Author	Senda, M.,   Senda, T.,   Kidokoro, S.
Experiment	X-RAY DIFFRACTION with resolution of 1.70 Å
Chain	A
EC	3.4.24.27

Gene Ontology

Cellular component	extracellular region (GO:0005576)
Molecular function	metalloendopeptidase activity (GO:0004222)
Biological process	proteolysis (GO:0006508)

LEUCYL AMINOPEPTIDASE...

image of leucyl aminopeptidase

Author	Kale, A.,   Dijkstra, B.W.,   Sonke, T.,
Experiment	X-RAY DIFFRACTION with resolution of 1.50 Å
Chain	A, B, C, D, E, F
EC	3.4.24.27

Gene Ontology

Cellular component	intracellular (GO:0005622)
Molecular function	aminopeptidase activity (GO:0004177)
Biological process	proteolysis (GO:0006508)

http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_Data_Bank

http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

memikat si dia....

"Ustaz, saya bakal melangsungkan perkahwinan Februari nanti. Harapnya, dapatlah saya dengar sedikit sebanyak nasihat dari ustaz sebagai bekal saya menempuh bahtera rumah tangga nanti," seorang sahabat dari seberang laut bertanyakan nasihat saya di suatu sore.


"Alahai Azman, awak pun tahukan, saya ni tunang pon tidak, macam mana nak jawab soal nikah kahwin ni..?" Saya menambah humor, menyempitkan jurang kami.
"Tak pernah pulak ustaz tak jawab kalau saya tanya sesuatu sebelum ni..?" Beliau menyoal saya semula.
"Kalau awak tanyakan pasal Fiqh Minoriti tentang rakan-rakan kita di Kutub Utara, mungkin ana boleh cuba j
awab. Tapi, kalau soal rumah tangga ni, susah sikit untuk saya respon. Belum ada pengalaman!" Saya cuba mendekatkan lagi telinga dan hati beliau terhadap pesan saya selepas ini. Biar hati itu betul-betul terbuka luas untuk menerima, sebelum saya menyuapkan resepi agung untuk berumahtangga.
Bukan alim, bukan berpengalaman. Hanya berkongsi apa yang pernah saya baca dan jumpa. Berkawan 


dengan orang tua-tua menemukan saya silibus yang tak akan ditemui dalam bilik kuliah.
"Apa matlamat utama awak?" Saya cuba membuat tawaran.
"Saya nak membahagiakan isteri saya," jawab beliau ikhlas. Nada suaranya sudah berubah. Sesuai dengan topik yang sedang kami bincangkan. Langkah ini langkah susah dan payah. Langkah kedua untuk mendirikan ummah yang berpayungkan khilafah.


"Kalau macam tu, senang sahaja. Pikat hati si dia. Ikatkan dengan hati awak. Pastikan hidup mati awak bersama. Bercinta hingga ke syurga, bak kata Ustaz Hasrizal," saya cuba mempromosikan produk.
"Nak pikat macam mana tu..? Boleh dikongsikan sedikit..?" Nada suaranya semakin ghairah untuk dijamukan resepi saya. Inilah masanya, umpan sudah mengena.


"Pertama sekali, selepas awak dan dia sudah halal dengan terlafaznya 'aku terima nikahnya', kucup dahinya dalam-dalam. Kalau berpeluang, kucuplah matanya. Kemudian, ucapkan di telinga si dia yang awak sangat cintakan si dia. Tapi, jangan lupa untuk ucapkan juga syukur pada yang mengurniakan cintanya pada awak, ALLAH. Sujud syukur! Lepas itu, ucapkan juga terima kasih yang tidak terhingga kerana sudi menerima awak sebagai peneman hidup," saya sedikit bersungguh sewaktu bercerita.


"Aiwah, romantik pulak ustaz ni. Pasti cair hati isteri saya nanti," galak suaranya dengan sedikit ketawa di seberang talian sana.
"Lepas tu, kalau berpeluang, rancangkan bulan madu bersama isteri. Tak perlu belanja yang tinggi, cuma pastikan peluang itu peluang yang berkualiti. Selaraskan komunikasi, selaraskan denyut nadi dan serasikan matlamat serta tujuan hidup masing-masing. Bersedia untuk menerima kekurangan dan mengiktiraf 


kelebihan masing-masing. Bincangkan masa depan dan satukan imaginasi korang berdua."
"Sekali sekala, adakan surprise untuk si dia walau hanya sekuntum bunga. Kalau ada bajet yang lebih, mungkin boleh dibelikan sesuatu yang lebih berharga."
"Satu lagi, nafkah. Ini perkara penting yang telah digariskan dalam syariat kita. Jangan lewat untuk menunaikan kewajipan awak walau isteri awak ada kerjaya."


"Seterusnya, jangan lupa, bila awak terpaksa berpisah atau tinggalkan si dia sementara waktu, kucup dahi dan matanya sebelum tinggalkan rumah dan selalukanlah untuk utuskan kata-kata rindu supaya hatinya sentiasa subur dengan bunga-bunga cintanya terhadap awak. Pastikan kamu sentiasa menghubunginya setiap masa. Jangan terlewat walau sesaat cuma."


"Lebih penting, tunjukkan yang si dia lebih penting dari segala-galanya. Jangan pula awak liat untuk bertanyakan khabar kondisi si dia sedang dalam masa yang sama, awak saban hari memeriksa enjin dan kondisi Produa Myvi di depan tangga!" Sedikit humor saya selitkan dalam wasiat yang agak sinis ini. Lalu, sedikit gelakan dapat saya tangkap di hujung talian.


"Jangan lupa, bincangkan secara baik, jadual pulang berhari raya. Bimbang si dia terluka kalau tidak pulang ke rumah mertua. Jadi, jangan kedekut untuk korbankan kampung halaman untuk kebahagiaan si dia."
"Huih, banyak benar ye petua ustaz, macam pakar! Ayat pula power, macam dah bercucu tiga. Ada lagi ke ustaz? Saya dah makin bersemangat ni," Azman semakin bersemangat. Setiap patah perkataan saya dicerap sebaik-baiknya. Respon pula sentiasa ada dicelahan setiap nasihat dan idea.


"Ye, ada lagi. Mungkin ini yang paling istimewa. Bila dah ada cahaya mata nanti, cinta kamu akan terbahagi dua. Separuh untuk isteri dan separuh untuk anak-anak.  So, jangan lupa untuk ungkapkan penghargaan yang tidak terhingga sepanjang tempoh hamil sehingga selepas bersalin. Ungkapan kita akan menjadi penguat semangat si dia untuk terus menempuh saat kritikal sepanjang tempoh hamil dan proses melahirkan bayi. Saya ada satu resepi rahsia," saya memancing lagi.


"Apa tu ustaz, tolonglah jangan rahsia, nanti rumah tangga saya kurang bahagia," usiknya sambil diselangi ketawa bahagia.
"Ok, resepi rahsianya, apabila anta sambut ulang tahun kelahiran anak-anak, hadiahkan juga cenderahati penghargaan kepada si dia yang berkorban 9 bulan mengandungkan anak-anak."
"Ada lagi ustaz?" Suaranya semakin galak.


"Habis. Setakat itu sahaja," saya memutuskan kata-kata. Titik noktah diletakkan di hujung bicara.
"Hai, saya tengah bersemangat ni... jantung pun tengah kencang berdegup, janganlah berhenti mengejut begitu ustaz. Nanti boleh jatuh strok saya jadinya." Selorohnya meminta perbualan kami diperpanjangkan lagi.


"Kalau awak strok, wasiatkan tunang awak untuk saya," saya berseloroh sambil ketawa bersahaja.
"Kalau awak masih sudi, masih ada resepi yang kurang menarik. Jarang orang suka mendengar resepi ini. Kalau awak betul-betul mahu, saya boleh sambung," nada suara saya mendatar.
"Boleh, saya sedia. Saya tahu, pasti akan ada manfaatnya," Azman masih bersemangat.


"Resepi ini bukan untuk memikat hati. Tapi untuk menghidupkan hati yang separuh mati. Mengesat air mata yang tak nampak alirannya. Meredakan pekikan suara hati yang tidak zahir bunyinya. Awak nak dengar ke?" Nada saya bertukar sedikit serius.
"Apa tu ustaz?" Nadanya kini berubah.
"Awak pernah kucup dahi ibu sendiri?" Tanya saya ringkas.


"Belum," ringkas juga jawapan Azman.
"Kucupi dahi ibu kamu sebelum kamu mengucup dahi isteri. Ibu itu yang berkorban 9 bulan mabuk, loya dan letih mengandungkan kita dan bersabung nyawa melahirkan kita. Mengasihi kita tanpa sebarang syarat ataupun mahar mahupun nafkah. Dahi ibu kita lebih layak untuk kita kucup sebelum kita kucup dahi isteri yang baru kita kenali beberapa bulan."


"Pernah awak  berbulan madu dengan ibu? Berkongsi tujuan dan matlamat hidup dengan ibu? Bergurau senda dan bermanja-manja dengan ibu? Kalau belum, honeymoon dulu dengan ibu awak. Kelak nanti, hatinya tidak begitu remuk melihat bahagianya bulan madu kita bersama isteri dengan melupakan jasa ibu yang pernah meletakkan seluruh hidupnya untuk kebahagiaan kita. Bahagianyahoneymoon kita sehingga terlupa untuk menghubungi ibu anta di desa sana."


"Pernah awak berterima kasih pada ibu kerana melahirkan awak? Ibu yang sepanjang hidupnya menemani hidup awak? Kalau masih belum diungkapkan, segerakanlah ia sebelum awak berterima kasih kepada isteri yang sudi menjadi peneman hidup awak. Ibu tua itu lebih aula (utama) menerima ucapan itu."
"Pernah surprisekan ibu awak dengan sesuatu hadiah yang istimewa? Kalau belum, surprisekan dulu si ibu itu. Nescaya, hatinya kembali berbunga-bunga. Ibu itu pastinya sunyi bila kehilangan kita, anak kesayangannya."


"Sewaktu kita mengira belanja harian dan nafkah untuk isteri, fikirkan juga nafkah dan belanja untuk ibu kita yang tak bergaji di desa sana. Ibu itu telah membesarkan kita tanpa sebarang upah mahupun bayaran. Ye, duit yang kita akan kirimkan itu bukannya bayaran terhadap kasih sayang mereka, tapi ianya menjadi tanda yang kita juga masih mengingati malah menyayangi mereka."


"Man, saya yakin, mak awak sangat sunyi waktu ini. Saban detik, telinganya pasti ingin mendengar deringan dari seberang laut. Pasti matanya selalu menatap potret awak yang digantung atau yang terselit di celah dompet. Hubungilah ibu awak sekerap yang mungkin. Kalaupun tidak seminggu sekali, pastikan dalam sebulan, khabar awak sampai kepada mak yang jauh di kampung."


"Man, kalau dengan satu ibu dan satu ayah, kita sudah tidak mampu untuk memikat hati kedua-duanya, saya bimbang lebih banyak hati-hati yang akan terluka selepas kita mempunyai dua ibu dan dua ayah."
Gelak ketawa bertukar menjadi esak dan sendu. Nada Azman yang riang kini berubah ke sebaliknya. Saya menghentikan kalam seketika. Suasana hening seheningnya. Hanya sedikit gangguan dari gelombang talian yang seakan-akan turut terpengaruh dengan suasana.


"Saya tak berniat untuk menghancurkan impian bahagia awak. Tapi, saya yakin dengan sempurnanya plot ini, awak akan lebih berbahagia. Ummat ini akan lebih berbahagia."
"Saya yakin yang awak sudah maklum. Bait Muslim (keluarga Islam) tidak akan sempurna tanpa sempurnanya Individu Muslim. Bagitulah juga, Masyarakat Muslim tidak akan lahir dari Bait Muslim yang 


tempang. Khilafah tidak akan terbina dengan Masyarakat yang tidak stabil. Bersemangatlah, kitalah pemulanya. Saya yakin, tarbiah yang awak lalui telah menjadikan awak Fardul Muslim (individu Muslim) yang baik. Tinggal lagi, Allah akan mendidik awak untuk melahirkan Bait Muslim yang baik. Adikku Azman, inilah jalannya."


"Go home and love your family."
Jawapan Mother Teresa selepas ditanyakan tentang bagaimana untuk mempromosikan keamanan kepada dunia. Pertanyaan itu diajukan beliau menerima Hadiah Nobel Keamanan pada tahun 1979.
"Sebaik-baik kamu adalah oran yang paling baik hubungannya dengan ahli keluarganya. Dan aku adalah orang yang paling baik untuk keluargaku." - Hadis


Pastikan perkahwinan kita membahagiakan sejuta hati. Memuaskan sejuta jiwa. Menghidupkan sejuta roh dan menyelamatkan sejuta ummah.
Mulailah dari diri kita. Dari rumah kita. Dari Isteri dan anak-anak kita. Dari masyarakat kita. Dari negeri kita. Dari negara kita. Moga payung khilafah akan menaungi kita kelak.


"Sesungguhnya Allah tidak akan mengubah nasib sesuatu kaum sehinggalah mereka mengubah nasib mereka sendiri." - Al-Quran

akhirnya......

first eleven first leg final suzuki cup...

skuad malaysia akhirnya merangkul Piala suzuki AFF (yg sblm nie dikenali sbg Piala tiger)
kekalahan 2-1 di tangan skuad indon di stadium gelora bung karno x membawa ape2 erti ag
setelah kte memegang defisit 3 gol...
pastinya kemengan nie berjaya mengelak dr cemuhan yg dilemparkan oleh rakyat indon konon nyea
mas bermaiin kotor dgn bermain laser...
sedangkan dlm game td khairul fahmi jelas sekali terkena pancaran laser tersebut( tp x dihiraukan)
semoga kemengan nie mencerahkan peluang skuad negara utk memasuki Piala dunia 2022 di qatar
smua pemain perlu diberikan pujian setelah menghadapi ujian penuh getir dlm mendapat kejuaraan ini

kemenangan kte juga mendapat perhatian dr player skuad MU, rio ferdinand dlm twitter nyea...

sorie x clear ngat nme mas..

http://twitter.com/rioferdy5

setelah itu, seluruh rakyat malaysia mendapat berita gemberi bahawa jumaat diumumkan sbg cti umum seluruh negara
tq la kpd PM yg perihatin dgn rakyat....

chem sketch....

finally.....
i managed to finish my second assignment for Computer in Science (KOS1110)
we were given a task to sketch chemical structure including lipids and DNA
although most of us are first time to use the software, but we work hard to make it successful....

example images...

Introduction

This is an introduction to the program ChemSketch, from ACD Labs. You can use ChemSketch to draw chemical structures, and to view them as three dimensional (3D) models.
The approach here is to show by example. I will lead you through one example in some detail, showing how to draw the structure, and how to convert it to 3D. After that, I will briefly show some other features.
No attempt is made here to teach all of ChemSketch. The idea is to guide you to some basics. If you can do the things shown here, you should then be ready to pursue more features of the program on your own -- as you need them.

ChemSketch is designed to be used on its own for drawing chemical structures, reactions, schematic diagrams or integrated with other ACD applications and as the front end to our software. Able to import Windows Metafile, MDL MOL, CS ChemDraw, or ISIS/Sketch BIN file. Export Bitmap, TIFF, Metafile, MOL, Paintbrush, ISIS/Sketch, GIF , and ChemDraw. Fully loaded with useful pre-drawn structures including lab equipment, DNA/RNA building kit, amino acids etc. Structures can be 2D "cleaned" as well as 3D optimized using ACD's powerful algorithm. Publish a professional quality report from within ChemSketch or drag drop structures/text into MS applications i.e. MS Word.

The ChemBasic language, which is integrated with ACD/ChemSketch chemistry drawing software, is intended to be a tool for

* manipulating chemical structures, both 2D- and 3D
* customizing ACD/Labs software, through direct access to its embedded functionality
* developing add-ons to ACD/Labs chemistry softw
to downloadd this software,surf to this web...

http://www.acdlabs.com/download/